東莞流水線流水段的處理時間越長，緩存寄存器的延遲時間越大，那么，這條流水線的吞吐量就越小。因為，在線性流水線中，吞吐率Tpmax=流水線時鐘周期△T/1=max(T1,...Ti,..Tm)+T1/1，而其中，m是流水線的段數(shù)，i是特定過程段執(zhí)行時間。如果，一條流水線的段數(shù)越多，過程執(zhí)行時間越長，那么，這條流水線的理論吞吐率就越小。
由此，要對于流水線的瓶頸部分的處理主要在于減少流水段的處理時間。實現(xiàn)的方法一般有兩種：
1、把瓶頸部分的流水線分拆，以便任務(wù)可以充分流水處理。流水段的處理時間過長，一般是由于任務(wù)堵塞造成的，而任務(wù)的堵塞會導(dǎo)致流水線不能在同一個時鐘周期內(nèi)啟動另一個操作，可以把流水段劃分，在各小流水段中間設(shè)置緩存寄存器，緩沖上一個流水段的任務(wù)，使東莞流水線充分流水。假如X流水段的處理時間為3T，可以把X流水段再細(xì)分成3小段，這樣，每小段的功能相同，但是處理時間已經(jīng)變成3T/3=T了。
2、在瓶頸部分設(shè)置多條相同流水段，并行處理。對付流水段的處理時間過長，還有另外一種方法，那就是把瓶頸流水段用多個相同的并聯(lián)流水段代替，在前面設(shè)一個分派單元來對各條流水段的任務(wù)進行分派。仍然假設(shè)瓶頸流水段的處理時間是△3T，那么經(jīng)過3條并聯(lián)流水段的同時處理，實際需要的時間只是△T。這樣，就達到了縮短東莞流水線流水段處理時間，但這種方法比較少以采用，因為要3段相同的流水段并聯(lián)，成本較高，而且，分派單元會比較麻煩處理。